Pürin Pirimidin Oranı

kaynağı değiştir]

Ana madde: Nükleik asit analogları

Çok sayıda suni nükleobaz türevi mevcuttur.

En yaygın kullanım alanı fluoresan problardır. bunlar rRNA veya cDNA'nın mikrodizi (mikroarray)'lerde işaretlenmesinde kullanılır.

Bazı araştırma grupları genetik kodu genişletmek için isoguanin veya isositozin gibi fazladan bazları kullanmaya çalışmaktadır. Bazı gruplar ise aynı amaçla 2-amino(2-tienil)pürin ve pirrolkarbaldehit gibi fluoresan bazları denemektedir.

Tıpta çeşitli nükleozit türevleri antikanser veya antiviral ilaç olarak kullanılmaktadır. Bu nükleozitler hücre içine alındıktan sonra nükleotitlere dönüşürler, viral polimeraz bu bazları viral nükleik aside dahil edince zincirin uzaması durur, virüs artık kendini çoğaltamaz.

Ayrıca bakınız[değiştir

Tez NoİndirmeTez KünyeDurumu
Türkiye'de yayılış gösteren paronychıa mıll. cinsine ait bazı taksonların nrDNA ıts bölgeleri bakımından karşılaştırılması / Comparation of some paronychia mill. (caryophyllaceae) taxa distributed in Turkey based on nrDNA data
Yazar:ZEYNEP TÜRKER
Danışman: PROF. DR. KAMİL COŞKUNÇELEBİ
Yer Bilgisi: Karadeniz Teknik Üniversitesi / Fen Bilimleri Enstitüsü / Biyoloji Ana Bilim Dalı
Konu:Biyoloji = Biology
Dizin: Onaylandı
Yüksek Lisans
Türkçe

67 s. Bu çalışmada Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) cinsine ait 34 takson (51 popülasyon) nrDNA ITS bölgesi üzerinden incelenmiştir. İncelenen taksonlardan 20'si ülkemizin önemli gen kaynaklarından biri olarak kabul edilen endemik türlerdir. DNA izolasyonunda kullanılan sağlıklı yaprak örnekleri TÜBİTAK tarafından desteklenen proje kapsamında yıllarında toplanmıştır. İncelenen her bir popülasyona ait ITS bölgeleri evrensel ITS primerleri kullanılarak çoğaltılmış ve baz dizin analizleri hizmet alımı yolu ile gerçekleştirilmiştir. Yapılan analizler sonucunda incelenen örneklerin nrDNA ITS bölge uzunluklarının bç, % GC içeriğinin 59,,3 ve Pürin/Pirimidin oranı 1, arasında değiştiği bulunmuştur. Çalışılan taksonların nrDNA ITS dizinleri (% 20)'sı parsimonik (bilgi verici), (% 32)'si değişken ve (% 59)'unun korunmuş (değişmeyen) bölge içerdiği bulunmuştur. İncelenen taksonlardan funduszeue.infoea var. argentea ve P. kayseriana' nın % 75,7' lik benzerlik düzeyiyle birbirine en uzak, P. davisii, P. adalia, P. lycica'nın' nin % ' lük benzerlik düzeyiyle birbirine en yakın taksonlar olduğu tespit edilmiştir. İncelenen taksonların nrDNA-ITS bölgesinin % GC içeriklerin de birbirine en uzak taksonlar P. argentea var. scariarissima ve P. carica var. stipulata iken, en yakın taksonlar ise P. davisii, P. adalia, P. lycica, P. carica olduğu tespit edilmiştir. Baz dizilerin filogenetik programlar ile değerlendirilmesi sonucu çalışılan taksonlar arası akrabalık ilişkileri belirlenmiş ve Paronychia cinsinin polifiletik bir yapıya sahip olduğunu destekleyen bir filogenetik yapıya sahip olduğu bulunmuştur. In this study, 51 populations belong to 34 Paronychia Mill. (Caryophyllaceae) taxa, including endemic 20 taxa for Turkey, were investigated in terms of nrDNA ITS data. Healthy leaf samples used in DNA isolation was collected during the field work of a project supported by TUBITAK (T) in ITS regions of the examined populations were amplified using universal primers and sequencing by Macrogen Inc. It was determined that length of ITS region varies from to bp, GC % content is between , the ratio of Purine / Pyrimidine varies from to The aligned sequence data of nrDNA ITS region belong to examined taxa contain parsimonik (20 %), variable (32 %) and conservative (invariant) site (59 %). It was also found that funduszeue.infoea var. argentea and P. kayseriana are the farthest taxa with % similarity level, P. davisii, P. adalia and P. lycica are the closely related taxa with % similarity level. Additionaly, according to GC % content, P. argentea var. scariarissima and P. carica var. stipulata are the farthest taxa, P. davisii, P. adalia, P. lycica, P. carica are the closely related taxa. As a result of phylogenetic analysis based on the nrDNA ITS data, Paronychia appears to be a polyphyletic genera.

nest...

92083 92084 92085 92086 92087